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以ALK融合基因检测浅谈PCR、IHC和FISH步骤的曲直

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目前指南推荐FISH检测作为ALK融合基因的尺度步骤,非幼细胞肺癌(NSCLC)的医治已进入到个别化医治的时期。肺癌中ALK变异重要为ALK基因产生沉排与其他基因融合。其中,EML4-ALK(棘皮动物微管结合蛋白样4-间变性淋巴瘤激酶)融合基因变异是其重要类型,约占所有NSCLC的5%左右[1]。ALK阳性的NSCLC固然仅占全数NSCLC的5%,但是每年新发病例数在中国仍靠近30,000例[2]。因而,若何正确诊断ALK阳性的NSCLC便成了临床上确当务之急。


目前针对ALK融合基因检测常用的步骤有三种—荧光原位杂交(FISH)、基于PCR扩增技术(RACE-PCR或RT-PCR结合测序技术、qRT-PCR等)和免疫组织化学法(IHC)。





上述三种步骤各有其优弊端。单一来说,FISH是临床试验验证的金尺度步骤  ;RT-PCR对标本取材要求较高,需专用的试剂盒进行检测,且只能检出已知的融合  ;IHC虽轻便易行,但阳性尺度不统一。


先来看看几项临床钻研:


在2014年,法国的雷恩大学医学院在国际肺癌钻研合作组的专业期刊Journal of Thoracic Oncology颁发了一篇沉要文章。对法国两家独立的中心,共3244例非幼细胞肺癌样本进行ALK检测,利用两种分歧步骤进行了平行分析比力。


总结如下:


?ALK总阳性率为150/3244(4.6%)

?在这150例ALK阳性病例中:

80/150 (53%)FISH+/IHC +   ;36/150(24%)FISH +/IHC-

19/150 (12.6%)FISH-/IHC +  ;15/150(10%)FISH fail/IHC+


以上面的数据来初步分析:针对ALK检测,IHC的假阴性率高达24%  ;FISH的假阴性率为12.6%。因而若是仅仅以IHC作为用药领导,将近有四分之一的ALK阳性病人无法使用ALK靶向医治。


到底以哪一个步骤为准?其实很单一,我们以疗效为准。


?在FISH + / IHC + 的患者中,有34/80例接受了克唑替尼的ALK医治,31/34有直接药物疗效反映,临床判定为医治有效。

?在FISH + / IHC - 的患者中,有6/36例接受了克唑替尼的ALK医治,4/6有直接药物疗效反映,临床判定为医治有效。另表两位后来发现有复发及再次诊断为鳞癌。

?在FISH - / IHC+ 的患者中,有2/19例接受了克唑替尼的ALK医治,2/2有直接药物疗效反映,临床判定为医治有效。但这两位患者带有ALK多倍体,且>6个细胞有融合信号,但是未达到15%的FISH阳性判读阈值。


综合以上数据,FISH的步骤在敏感性及特异性上更高一些。所以我们要强调的是,FISH的诊断相对于IHC来说,它是一种越发客观的步骤,而IHC的了局判定越发主观一些。


2018年新指南明确指出:FISH、IHC或基于序列特异性的PCR技术均可作为ALK阳性肺癌的诊断技术,检测尝试室应该凭据组织标本类型选择相宜的检测技术。当疑惑一种技术的靠得住性时(如FISH的肿瘤细胞融合率靠近15%时),能够思考选取另一种技术加以验证。

指南中三种步骤总结如下:

____

_____
____


项目

FISH

IHC

(q)RT-PCR

临床切合率

高,金尺度

高,存在假阳性

检测用度

可检测的融合型

所有融合型

所有融合型但不能分辨

已知的融合型

所需组织量

厚度3-5μm石蜡切片

厚度3-5μm石蜡切片

100-500ng RNA

利益

活络度和特异性高

操作轻便、价值便宜

了局判读单一

不及之处

检测用度高,能检出所有的融合但不能分辨


判定尺度主观、阳性尺度不统一

无法检测未知的融合型、对RNA质量和检测环境要求高


参考文件:

1. Soda M, Choi YL, Enomoto M, et al. Identif cation of the transforming EML4-ALK fusion gene in non-small-cell lung cancer[ J]. Nature, 2007,448(7153): 561-566.

2. Chabner BA. Early accelerated approval for highly targeted cancer drugs[ J]. N Engl J Med, 2011, 364 (12): 1087-1089.

3. Savic S, Bode B, Diebold J, et al. Detection of ALK-positive nonsmall-cell lung cancers on cytological specimens: high accuracy of immunocytochemistry with the 5A4 clone[ J]. J Torac Oncol, 2013, 8(8): 1004-1011

4.Camidge DR, Bang YJ, Kwak EL, et al. Activity and safety of crizotinib in patients with ALK-positive non-small-cell lung cancer: updated results from a phase 1 study[ J]. Lancet Oncol, 2012, 13(10): 1011-1019.

5. Shaw AT, Kim DW, Nakagawa K, et al. Crizotinib versus chemotherapy in advanced ALK-positive lung cancer[ J]. N Engl J Med, 2013,368(25): 2385-2394.

6. Rodig SJ, Mino-Kenudson M, Dacic S, et al. Unique clinicopathologic features characterize ALK-rearranged lung adenocarcinoma in the western population[ J]. Clin Cancer Res, 2009, 15(16): 5216-5223.


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