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临床上少见的AKAP9-BRAF沉组和BRAF基因K601E点突变常与辐射有关的乳头状癌产生有关。
很多学者提出BRAF突变和沉排阳性的甲状腺癌患者相对于阴性的患者而言拥有更强的侵袭性，从而在医治上必要执行行甲状腺全切术加中心淋趋附断根，术后必要更高剂量的放射性碘医治，更低的促甲状腺激素抑造，并且亲昵随访。
BRAF突变和沉排有助于在细胞状态学不典型和取样欠安的情况下做出比力有效的诊断，在细胞状态不典型和可疑时对明确肿瘤的性质拥有沉要意思。

中枢神经系统胶质瘤的一种分子分型，其中毛细胞星形细胞瘤、弥漫性软脑膜胶质神经元肿瘤中常存在BRAF基因融合，其他一些儿童低级别胶质瘤中也可存在BRAF基因融合
；尤其以KIAA1549-BRAF融合最为常见。此表钻研发现存在BRAF基因融合的胶质瘤比BRAFV600E突变或BRAF野生型的胶质瘤预后较好
；因而检测BRAF基因融合状态为病理诊断与甄别诊断、临床诊治及预后评估提供了援手。